Zymo Research เปิดตัวซอฟต์แวร์ชีวสารสนเทศศาสตร์ รองรับการตรวจหาเชื้อโควิดในน้ำเสีย

การเปิดตัว VirSieve(TM) Bioinformatics Pipeline จะช่วยส่งเสริมความร่วมมือด้านการวิจัยไวรัส SARS-CoV-2 ในสิ่งแวดล้อม

 

Zymo Research เปิดตัวซอฟต์แวร์ VirSieve(TM) Bioinformatics Pipeline สำหรับชุมชนจุลชีววิทยาสิ่งแวดล้อม เพื่อส่งเสริมความร่วมมือทั่วโลกและสนับสนุนการตรวจหาเชื้อไวรัส SARS-CoV-2 สายพันธุ์ต่าง ๆ ในน้ำเสีย โดย VirSieve(TM) เป็นซอฟต์แวร์อัตโนมัติที่สามารถวิเคราะห์ลำดับสารพันธุกรรมของเชื้อไวรัส SARS-CoV-2 จากตัวอย่างน้ำเสีย เพื่อให้เข้าใจมากขึ้นเกี่ยวกับสายพันธุ์ของไวรัสที่พบในชุมชน ซอฟต์แวร์นี้สามารถประเมินช่วงความเชื่อมั่น (confidence interval) ในการกลายพันธุ์ของไวรัส จึงวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงของสารพันธุกรรมของเชื้อไวรัสได้อย่างแม่นยำขึ้นมาก

 

ศูนย์ควบคุมและป้องกันโรคของสหรัฐอเมริกา (CDC) ระบุว่า การฉีดวัคซีนมีผลดีอย่างมหาศาลในการควบคุมการแพร่ระบาดของเชื้อไวรัส SARS-CoV-2 ในสหรัฐอเมริกา แต่ยังคงมีไวรัสสายพันธุ์ใหม่เกิดขึ้น โดยบางสายพันธุ์ เช่น B.1.1.7 ถูกจัดว่าเป็น "สายพันธุ์น่ากังวล" เนื่องจากมีหลักฐานว่าแพร่กระจายเร็วขึ้น มีความสามารถในการก่อโรคมากขึ้น หรือดื้อวัคซีนมากขึ้น ด้วยเหตุนี้ การตรวจหาเชื้อในน้ำเสียจึงเป็นทางออกที่เหมาะสมที่สุดในการตรวจตราสถานการณ์ในชุมชนแบบเกือบเรียลไทม์  

 

การตรวจลำดับสารพันธุกรรมของเชื้อไวรัสในน้ำเสียเป็นเรื่องที่ทำได้ยาก เนื่องจาก RNA ของไวรัสมีการเสื่อมและแตกกระจาย ส่งผลให้การตรวจลำดับสารพันธุกรรมของเชื้อไวรัสเกิดความผิดพลาด จนทำให้เกิดการเข้าใจผิดว่ามีการกลายพันธุ์ อย่างไรก็ดี VirSieve(TM) สามารถระบุความผิดพลาดเหล่านี้และแจ้งว่าความน่าเชื่อถือต่ำหรือไม่มีความน่าเชื่อถือ ช่วยให้นักวิจัยสามารถคัดกรองไวรัสกลายพันธุ์โดยมีข้อมูลสนับสนุนที่น่าเชื่อถือมากขึ้น นอกจากนี้ Zymo Research ยังใช้อุปกรณ์เก็บตัวอย่าง DNA/RNA Shield(TM) ที่ช่วยปกป้อง RNA ของไวรัสจากการเสื่อมเพิ่มเติม หลังจากที่ทำให้ไวรัสหยุดทำงานเพื่อเก็บในอุณหภูมิที่เหมาะสมและขนส่งตัวอย่างน้ำเสียอย่างปลอดภัย

 

"ก่อนหน้านี้ Zymo Research ได้พัฒนาซอฟต์แวร์สาธารณะอย่าง Zymo Research Transmit Program สำหรับส่งผลทดสอบโควิด-19 ผ่านระบบรายงานสาธารณสุข CalREDIE" Dr. Michael Weinstein ผู้อำนวยการระบบสารสนเทศทางห้องปฏิบัติการ และหัวหน้าโปรเจค VirSieve(TM) Pipeline ของ Zymo Research กล่าว "VirSieve(TM) เป็นความพยายามส่วนหนึ่งของ Zymo Research ในการสนับสนุนการรับมือโรคระบาดทั่วโลกอย่างเต็มที่ โดย VirSieve(TM) ไม่เพียงมีศักยภาพในการตรวจสอบไวรัส SARS-CoV-2 สายพันธุ์ต่าง ๆ ในน้ำเสียเท่านั้น แต่ยังรวมถึงไวรัสอื่น ๆ ด้วย จึงสามารถตอบสนองความต้องการด้านสาธารณสุขในอนาคต"

 

"การตรวจสอบสายพันธุ์ของไวรัสอย่างแม่นยำจากตัวอย่างหรือน้ำเสีย คือกุญแจสำคัญในการระบุสายพันธุ์ไวรัสอย่างถูกต้อง และเป็นประโยชน์ต่อการติดตามจุลินทรีย์ก่อโรค" Dr. Christopher Mason โฆษกของ Zymo Research และผู้อำนวยการร่วมของ WorldQuant Institute for Quantitative Prediction และศาสตราจารย์ภาควิชาสรีรศาสตร์และชีวฟิสิกส์ของ Weill Cornell Medicine กล่าว

 

สามารถดูข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับ VirSieve(TM) Pipeline ได้ที่เว็บไซต์ของ Zymo Research หรือติดต่อที่ tech@zymoresearch.com

 

เกี่ยวกับ Zymo Research Corp.

Zymo Research เป็นบริษัทเอกชนที่ให้การสนับสนุนแวดวงวิทยาศาสตร์และการวินิจฉัยโรคด้วยเครื่องมือด้านชีวโมเลกุลสุดล้ำมาตั้งแต่ปี 1994 หลักการดำเนินงานของบริษัทคือ "วิทยาศาสตร์เป็นสิ่งสวยงามเพราะทำให้สิ่งต่าง ๆ ง่ายขึ้น" ซึ่งสะท้อนให้เห็นในผลิตภัณฑ์ทุกชิ้นของบริษัท ไม่ว่าจะในเรื่องอีพีเจเนติกส์ไปจนถึงเทคโนโลยีทำให้ DNA/RNA บริสุทธิ์ ทั้งนี้ Zymo Research ได้รับการยกย่องตลอดเวลาที่ผ่านมาว่าเป็นผู้นำในแวดวงอีพีเจเนติกส์ โดยบริษัททลายขีดจำกัดเดิม ๆ ด้วยโซลูชันใหม่ ๆ สำหรับการเก็บตัวอย่าง การวัดไมโครไบโอม อุปกรณ์วินิจฉัย และเทคโนโลยี NGS ที่ล้วนแล้วแต่มีคุณภาพสูงและใช้งานง่าย ติดตาม Zymo Research ได้ทาง Facebook, LinkedIn, Twitter และ Instagram

 

ดูข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับผลิตภัณฑ์กลุ่มโควิด-19 ของ Zymo Research ได้ที่ลิงก์ด้านล่าง

 

- Zymo Research Releases Free Software to Streamline COVID-19 Test Reporting   

- Zymo Research Obtains CE IVD Mark for its Quick SARS-CoV-2 Multiplex Kit  

- Zymo Research Obtains Emergency Use Authorization from FDA for Their Quick SARS-CoV-2 rRT-PCR Kit  

- Zymo Research Receives CE IVD Mark for its Quick-DNA/RNA(TM) Viral MagBead Kit  

- Zymo Research Launches COVID-19 Sequencing Service for the Detection and Surveillance of Emerging SARS-CoV-2 Variants  

- Zymo Research Offers Community-Wide SARS-CoV-2 Detection and Variant Tracking with the Environ(TM) COVID-19 Wastewater Testing Service  

- Zymo Research Receives 510(k) Clearance for its Collection/Transport Device for COVID-19

 

รูปภาพ - https://mma.prnewswire.com/media/1507133/Wastewater_PR_data_on_computer_2000x1111px.jpg

โลโก้ - https://mma.prnewswire.com/media/364743/Zymo_Research_Corp_Logo.jpg